自1981年日本微生物保藏中心（JCM）成立以來，RIKEN-BRC的微生物部門一直在收藏，保存和分發(fā)培養(yǎng)的微生物菌株，作為微生物保藏中心之一.JCM旨在通過維護(hù)科學(xué)社區(qū)做出貢獻(xiàn)。并提供高質(zhì)量的微生物資源，可用于一般微生物研究和各種研究領(lǐng)域，特別是在健康和環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域。 JCM參加了由日本教育，文化，體育，科學(xué)和技術(shù)部支持的國家生物資源項(xiàng)目，“General Microbes”被看作是核心競(jìng)爭(zhēng)力。

截至2017年11月，JCM保藏了約25,600株菌，JCM可用菌株的近似數(shù)量為：11,700株好氧和厭氧細(xì)菌，包括放線菌，530株古菌和5,200株真菌，包括酵母菌（總計(jì)約17,500株）。在JCM保藏的菌株限于風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估等級(jí)1或2中的菌株。一些菌株的基因組DNA樣品也與RIKEN BRC-DNA Bank合作分發(fā)。每年向國內(nèi)外研究人員贈(zèng)送3500多株菌株。

JCM正在努力不斷改進(jìn)作為微生物資源中心的功能，開發(fā)新的微生物資源，描述新的微生物類群，并開發(fā)研究和處理極端微生物，未培養(yǎng)的微生物和微生物群落的方法。 JCM的質(zhì)量管理體系已獲得ISO 9001：2015認(rèn)證，以維持和提高其服務(wù)質(zhì)量。為了促進(jìn)微生物菌株的使用，JCM定期發(fā)布mailnews和newsletter（日語），并提供基礎(chǔ)和上等微生物技術(shù)的培訓(xùn)課程。

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